Цветет в мае-июне. Плодоносит в сентябре-октябре.

В природе наиболее распространена в Японии. Однако крайней северной точкой произрастания является о. Кунашир (Курильские острова.), и, таким образом, магнолия обратнояйцевидная является единственной магнолией, имеющей природный ареал в России.

Чистых насаждений не образует. Встречается преимущественно в горных широколиственных лесах совместно с Fraxinus longicuspis, буком японским (Fagus japonica), дубом курчавым (Quercus crispula), грабом сердцелистным (Carpinus cordata), видами родов Клён (Acer) и Берёза (Betula) на высотах 1700—2000 м.

Введена в культуру в 1865 г. В России культивируется на Черноморском побережье Кавказа, где цветет и плодоносит. Успешно интродуцирована на Украине (Киев, Львов, Черновцы, Скала-Подольская), где давно цветет и дает семенное воспроизводство. Отдельные деревья имеются в Ленкорани (Азербайджан). Последние годы показали, что магнолия обратнояйцевидная киевской репродукции также успешно растет и цветет на широте Воронежа, достаточно устойчиво развивается в частных коллекциях в Подмосковье. На Северо-Западе России значительной статистики еще не собрано, по ограниченным наблюдениям, в Санкт-Петербурге сильно обмерзает и требует защиты на зиму.

Магнолия обратнояйцевидная - исключительно ценная декоративная порода, обладающая сравнительно высокой холодостойкостью.

С лечебной целью используют кору, бутоны, цветки, плоды, корни. В корнях обнаружены алкалоиды, в стволе - рутин, в коре ствола - алкалоиды, фенолы, бифенилы. В листьях содержатся эфирное масло, алкалоиды, рутин, высшие жирные кислоты. В лепестках и пыльце обнаружен рутин, в плодах - антоциан, в семенах - жирное масло.

В китайской и японской медицине кору стволов и плоды используют как болеутоляющее, антигельминтное, мочегонное, вяжущее; цветки и бутоны в виде порошка применяют как жаропонижающее и болеутоляющее, в частности при головной боли, а также при ринитах, неприятном запахе изо рта. Отвар корней эффективен как отхаркивающее средство, а отвар коры употребляют для лечения язв. Отвар коры и плодов используют при болях в желудке, для улучшения аппетита, как тонизирующее работу желудочно-кишечного тракта.

Следует помнить, что магнолия обладает ядовитыми свойствами. Так, например, аромат большого букета магнолии, стоящего в комнате, может через несколько часов вызвать у находящихся там людей головную боль, головокружение, чувство разбитости и т. п. Лучшей помощью в этих случаях является свежий воздух.